Les effluents issus d’élevages aquacoles ne sont pas soumis à la règlementation sur la gestion des effluents. Des données réglementaires concernant l’irrigation de cultures avec des « eaux usées » (station d’épuration, eaux de traitements d’industries agroalimentaire…) existent mais aucune catégorie définie (en France et UE) n’intègre l’eau enrichie en effluents en provenance d’élevages aquacoles. Arrêté du 2 août 2010, complété par l’arrêté du 25 juin 2014.